A full-time expert in image analysis and quantification (Bioinformatician)

Type d’annonce: Proposition – Postes CDD

Description de la proposition:

This expert / logistician should collaborate closely with biomedical researchers, in collaboration with the GIGA-Cell Imaging platform, for experimental planning: optimize their sample preparation procedures and their image acquisition protocols in order to minimize acquisition bias and artefacts and ease reproducible morphometric quantification;
Maximize the use of existing image quantification softwares (including FIJI, Imaris, Cytomine, Image J, …) by coordinating software installation, developing new adapted plug-ins, optimizing the configuration, maintenance;
Maximize the use of high-performance computing and mass storage equipment by developing software communication and user interfaces between imaging instruments (incl. whole-slide scanner, confocal microscopes, high content screening imaging system, lightsheet and epifluorescence microscopes managed by the Cell Imaging GIGA platform), computing infrastructure (grid computing and mass storage), and end-users (biomedical researchers and computer scientists developing algorithms);
Implement image format conversion tools to ease image storage and sharing;
Implement additional quantification software modules to answer specific biomedical questions;
Implement research results (new algorithms) into usable and efficient software modules;
Write protocols and documentation for end-users to describe quantification workflows, pipelines, platforms.
Organize training sessions on basic image analysis principles and software. Organize workshops on advanced topics to foster sharing of knowledge between biomedical experts and computer scientists.
Offer daily imaging data analysis consultation and services for users of the Cell imaging GIGA platform.
Act as an interface between biomedical researchers and computer scientist researchers.
Contribute to the submission of national/international research projects that involve biomedical image quantification.

Proposé par: Sandra Ormenese
Email: Sandra.Ormenese@ulg.ac.be
Website: http://www.giga.ulg.ac.be/cms/j_6/fr/accueil-internet
Laboratoire/Institution: GIGA, Université de Liège, Belgium
Adresse: Av de l’hôpital, 1 B34 4000 Liège Belgique, Liège, 4000, Belgium
Details en pdf: http://gdr-miv.fr/gdr/wp-content/uploads/formidable/Open-position-GIGA-ULg-–-Bioinfo-Imaging.pdf

Poste d’Ingénieur en Biophysique/Microscopie financé par la Fondation pour la Recherche Médicale

Type d’annonce: Proposition – Postes CDD

Description de la proposition:

Le projet de l’équipe est d’élucider les mécanismes moléculaires impliquant la glycoprotéine soluble
chromogranine A (CgA) permettant la biogenèse des granules de sécrétion, organites supports de la
sécrétion hormonale dans les cellules neuroendocrines, dans des conditions physiologiques et
physiopathologiques (tumeurs neuroendocrines, maladies neurodégénératives). Dans ce contexte,
l’ingénieur étudiera l’interaction CgA/acide phosphatidique (PA) ainsi que la formation de microdomaines au niveau de la membrane golgienne et de la membrane plasmique dans les cellules neuroendocrines vivantes. A cette fin, des outils moléculaires fluorescents seront disponibles et de nouvelles sondes PA photoactivables et biocompatibles sont en cours de synthèse. Les techniques d’imagerie telles que la microscopie confocale, la microscopie STED, la microscopie à ondes évanescentes, la microscopie biphotons et la spectroscopie à corrélation de fluorescence seront à disposition sur la plate-forme d’imagerie cellulaire (PRIMACEN) de l’IRIB et au CIML.
Le candidat devra être titulaire d’un Master ou d’un doctorat en imagerie cellulaire ou en biophysique,
accompagné d’une forte expérience en microscopie à fluorescence sur cellules vivantes, en analyse
d’images et en recherche expérimentale, et être motivé par les questions de biologie cellulaire, telles que la dynamique membranaire. Des connaissances en biochimie et biologie moléculaire sont également
souhaitées.

Proposé par: Maité MONTERO
Email: maite.montero@univ-rouen.fr

Laboratoire/Institution: Inserm U1239
Adresse: Université de Rouen, Rouen, 76000, France
Details en pdf: http://gdr-miv.fr/gdr/wp-content/uploads/formidable/6/profil-Ingenieur-FRM-Montero.pdf

ingenieur de recherche

Type d’annonce: Proposition – Postes CDD

Description de la proposition:

The group of Laure CRABBE « Telomeres and Genome Organization » is hiring
a Research Engineer on an ERC funded project to develop super resolution and live
cell microscopy experiments. The team is part of the Institute for Integrative Biology of
the Cell (I2BC), in Gif-sur-Yvette near Paris.
The candidate will be in charge of generating and analyzing confocal and super
resolution microscopy data from different target proteins involved in telomere
anchoring to the nuclear envelope in human cells. Similar methods will also be used to
characterize the positioning of chromosomal markers in the 3D nuclear volume and
their dynamic over the cell cycle in living cells. The candidate should be able to
apprehend a biological question while having a strong expertise in photonic microscopy
and image data analysis.

Proposé par: laure crabbe
Email: Laure.CRABBE@i2bc.paris-saclay.fr

Laboratoire/Institution: Institute for integrative biology (I2BC)
Adresse: 1 Avenue de la Terrasse, Bâtiment 26, Gif sur Yvette, 91190, France
Details en pdf: http://gdr-miv.fr/gdr/wp-content/uploads/formidable/IR-2017-eng.pdf

Ingénieur D’Études En Plateforme Scientifique

Type d’annonce: Proposition – Postes CDD

Description de la proposition:

L’Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC) recrute actuellement en CDD pour la plateforme de la microscopie photonique de son Centre d’Imagerie, un Ingénieur d’Etudes en plateforme scientifique.
Contrat à Durée Déterminée renouvelable jusqu’à 3 ans
Description complète du profil de poste: http://www.igbmc.fr/igbmc/recrutement/job_offer/375/

Proposé par: Elvire GUIOT
Email: elvire.guiot@igbmc.fr
Website: http://www.igbmc.fr
Laboratoire/Institution: IGBMC – UMR7104
Adresse: 1, rue Laurent Fries, Illkirch, 67404, France
Details en pdf: http://gdr-miv.fr/gdr/wp-content/uploads/formidable/CDD_IE_ImageriePhotonique_IGBMC.pdf

Recherche active d’un poste au titre d’Ingénieur d’Etude en Biophotonique

Type d’annonce: Demande – Postes CDD

Description de la proposition:

Je me permets de vous transmettre ma candidature spontanée pour un poste d’Ingénieur d’Etude en Biophotonique dans un laboratoire de Recherche et Développement.

En effet, titulaire d’un BTS Biophysicien de Laboratoire à l’Ecole Technique Supérieure du Laboratoire (ETSL) et d’une Licence Professionnelle Biophotonique à l’Université Paris Diderot durant lesquelles j’ai effectué diverses expériences professionnelles dans le domaine de la biologie cellulaire, biophysique et de la biophotonique.
J’ai ensuite obtenu un Master Biologie Santé Ecologie de l’Ecole Pratique des Hautes Etudes (EPHE) à Paris durant lequel j’ai réalisé un stage dans le laboratoire de Résonance Magnétique Nucléaire des Biomolécules au sein de l’Institut Pasteur où j’ai pu acquérir des compétences supplémentaires en biologie structurale et biologie moléculaire.
( Projet du groupe: https://research.pasteur.fr/fr/project/bacterial-transmembrane-signalling/ ).

Disponible immédiatement, je reste à votre entière disposition pour convenir d’un entretien au cours duquel je pourrai vous exposer plus en avant mes motivations et la plus value que je peux vous apporter.

SITBON Déborah

Demandé par: Déborah SITBON
Email: d.sitbon14@gmail.com
Website: https://research.pasteur.fr/fr/team/nuclear-magnetic-resonance-of-biomolecules/
Adresse: 25-27 rue du docteur roux, Paris, 75015, France

CV: http://gdr-miv.fr/gdr/wp-content/uploads/formidable/DéborahSitbon__CV_-4.pdf