Ateliers Prémodules et Modules avancés 2016

Ateliers actuellement disponibles

Liste 2014
Titre Auteurs Pdf
A1 Photoconversion in the whole zebrafish embryo, pros and cons for the study of haematopoiesis (Lancino) pdf
A2 Utilisation de la microscopie de seconde harmonique pour l’étude de l’organisation du collagène au sein d’un tissu synthétisé par des cellules en culture (Marais)
A3 Culture cellulaire et transfection pour les non-biologistes (Muriaux))
A4 3D Structured Illumination Microscopy: From the sample preparation to the quality control (Mateos langerak)
A5 A second-generation FRET biosensor of Aurora A to follow the activation of the endogenous kinase throughout the cell cycle. (Bertolin & Sizaire)) pdf
A6 Adaptive biology: Minimization of refractive index mismatch to improve axial resolution and transparency (Bolte & Lam) pdf
A7 Analyse d’images en biologie végétale, approches par morphologie mathématique Legland & Prigent) pdf
A8 Analyse spatiale pour la microscopie de fluorescence en deux canaux (Gilles & Contremoulins) pdf
A9 Correlative Light Electron Microscopy Image and Volume Registration (Paul-gilloteaux) pdf
A10 De l’acquisition à l’analyse des données de PALM sur bactéries vivantes (Le bars & Besse) pdf
A11 De l’imagerie de fluorescence ex-vivo, à l’in vivo sur modèles murins : imagerie intra-vitale haute résolution et photoconversion. (Salomé – desnoulez & Laplace-builhe) pdf
A12 Dynamique et nano-ablation des microtubules (Georget) pdf
A13 Evaluation de l’effet cytostatique d’agents chimiothérapeutiques sur de multiples lignées tumorales par microscopie à semi-haut débit (Twyffels) pdf
A14 From Confocal to STED microcopy: Why? How? and beyond. (Camille))
A15 Image Correlation Spectroscopy: dynamics and oligomerization of Paxilin in live cells by RICS and N&B (Digman)) pdf
A16 Imagerie de cerveaux de rongeur clarifiés par microscopie à feuillet de lumière (Michel) pdf
A17 Imagerie dynamique et photoablation de cystes des cellules des mammifères (Gurchenkov & Recher) pdf
A18 Intelligent microscopy : Automatisation et optimisation d’acquisition de données par couplage entre acquisition et analyse d’images (feedback microscopy) (De rossi & Sarrazin) pdf
A19 L’imagerie moyen débit par scanner de lames : étude de l’évolution d’une bactérie pathogène en symbiotique dans les plantes. (Pouzet) pdf
A20 Measure of surface protein mobility on live cell with u-paint technique (Hosy & Compans) pdf
A21 Measurement of viscoelastic membrane properties in living tissues after laser micro-ablation (Clément & Dutertre-sioen) pdf
A22 Mesure de changements de viscosité de la membrane plasmique de cellules végétales en réponse à un stress biotique par FLIM. (Waharte & Noirot) pdf
A23 Mesure de la diffusion dans les biofilms bactériens grâce à la technique de FRAP en microscopie confocale. (Canette & Waharte) pdf
A24 Mesure de l’impact du remodelage de la chromatine aux sites de cassure sur la diffusion des protéines par micro-irradiation laser (Dutertre-sioen & Clément) pdf
A25 Méthodes d’études de la dynamique dans la cellule par photo-conversion ou FRAP : avantages et limites (Abélanet & Baudin) pdf
A26 Métrologie : Quels outils pour quelles mesures ? (Frere & Dauphin) pdf
A27 Microscope modulaire à feuille de lumière et nouvelles sondes biocompatibles pour l’étude de la morphogénèse du poisson-zèbre (Ortiz & Rausch) pdf
A28 Observation de la dynamique d’une protéine de réparation de l’ADN chez la levure par la technique sptPALM (Guedj) pdf
A29 Organisation spatiale des signaux de mort/survie dans le coeur de souris après ischémie-reperfusion : clarification d’organe et microscopie en feuille de lumière. (Bidaux & Durand-terrasson)
A30 Programmation graphique et scripting avec Icy (Dallongeville & Dufour) pdf
A31 Recalage rapide d’images multivues en microscopie à feuille de lumière (Rousseau) pdf
A32 Révélation de sous-populations cellulaires dans l’intestin grêle et séparation d’auto-fluorescence de tissus par imagerie confocale spectrale à 10 couleurs (Mailfert & Fallet) pdf
A33 SHG/THG pour le tracking de nanoparticules harmoniques à l’échelle subcellulaire et tissulaire, thérapie cellulaire myopathie de Duchenne. (Dubreil & Lovo) pdf
A34 Stratégies d’optimisation en nanoscopie STED (Schapman & Bénard) pdf
A35 Suivi de protéines fluorescentes en Time Lapse chez la bactérie (E. coli) (Cantaloube & Rech) pdf
A36 The mechanical identity of cells at the shoot apical meristem in Arabidopsis, using combination of AFM, Confocal imaging and Nanoindentation plugin (Dubrulle) pdf
A37 Utilisation des opérateurs différentiels pour la segmentation d’images (Fertin & Usson)
A38 3D high and super-resolution imaging of biological samples using a single-objective Selective Plane Illumination Microscope (Galland & Sibarita) pdf
A39 3D-Imaging of biological samples with light sheet fluorescence microscopy: assembly, calibration and acquisition (Girard & Blanc) pdf
A40 Analyse spatio-temporelle en cellule vivante par corrélation d’image de temps de vie (Le Nézet & Gonzalez pisfil) pdf
A41 Bringing High-Throughput into an Innovative Super Resolution imaging system to evaluate immuno-modulatory Biologics (Casse) pdf
A42 Chauffage par laser IR provoquant l’expression d’un gène de manière locale dans l’embryon de C.elegans. (Chardes & Castellani) pdf
A43 Correlative imaging : From confocal microscopy to high resolution (SIM) (Sengmanivong & Sikora) pdf
A44 Counting proteins within complexes by single-molecule localization microscopy (Beaudouin & Bourgeois) pdf
A45 Déconvolution 3D pour la microscopie de fluorescence (Soulez & Thiébaut) pdf
A46 High speed life imaging using FPGA synchronisation (Mateos langerak) pdf
A47 High-throughput single-DNA molecule microscopy using automated micropatterning (Salome) pdf
A48 Imagerie à feuille de lumière multivue et confocale avec le MuVI SPIM (De rossi & Georget) pdf
A49 Imagerie de retardance optique d’échantillons biologiques sans marquage par microscopie de phase quantitative résolue en polarisation (Savatier) pdf
A50 Imagerie mutiphotonique appliquée à l’étude du trafic intracellulaire in vivo : effet du microenvironnement sur la localisation d’endosomes. (Irondelle & Simon) pdf
A51 Imaging whole zebrafish specimen after CLARITY transparization (Affaticati) pdf
A52 Localisation axiale en nanoscopie de fluorescence (Cabriel & Dupuis) pdf
A53 Mesures de FCS et analyse anomale in vivo : vers une compréhension de la dynamique, et fonctionnalité des complexes de régulation de la transcription (Gonzalez pisfil & Le Nézet) pdf
A54 Micro/nanoscopie de fluorescence basée sur la collection de l’émission super-critique par un objectif à très grande ouverture numérique (Bourg & Jouchet) pdf
A55 Microscope modulaire à feuille de lumière et nouvelles sondes biocompatibles pour l’étude de la morphogénèse du poisson-zèbre (Dumont & Bruneau) pdf
A56 Microscopie Multiphotonique In-Situ et Tissus Clarifiés (Guilbert & Drouet) pdf
A57 Multiple Optical Traps: an easy-to-use module (Girard & Mehidi) pdf
A58 New developments for multiplexed observation in fluorescence microscopy (Le saux & Gautier) pdf
A59 Périphériques connectés: réalisation et pilotage depuis Micro-Manager (Mutterer & Rouviere) pdf
A60 Pilotage Optimal en Microscopie Multidimensionnelle (Tramier & Otmane) pdf
A61 Préparer un embryoïde cellulaire humain pour l’imagerie rapide, inclusion en capsule d’hydrogel (Alessandri & Guiot) pdf
A62 Printing protein micropatterns for cellular imaging (Studer & Strale) pdf
A63 Protrusion Force Microscopy (Poincloux & Bouissou) pdf
A64 Recalage tridimensionnel X, Y, Z en nanoscopie. (Mangeat & Bon) pdf
A65 Reconstruction et modélisation statistique de distributions spatiales 3D avec le logiciel Free-D (Biot & Andrey) pdf
A66 Super Resolution SIM et Micro Patterning (Nedellec & Hulin) pdf
A67 Super-résolution 3D par imagerie de phase en fluorescence (Bon & Linarès) pdf
A68 Temperature microscopy in living cells (Baffou & Robert) pdf
A69 Comment générer du contraste sur n’importe quel microscope sans avoir recours à la fluorescence? De l’illumination oblique jusqu’à l’imagerie de phase quantitative. (Bon & Linarès) pdf
A70 Coordinate-based quantification of single-molecule localization microscopy data. (Levet & Beghin) pdf
A71 Could elasticity difference be measure on nucleus? (Dubrulle) pdf
A72 Deciphering lipid droplet biogenesis with live STED in plant tissues. (Mascalchi & Brocard) pdf
A73 Découverte d’une technique d’imagerie sans marquage : la microscopie tomographie diffractive (Debailleul & Simon) pdf
A74 Dispositif de contrôle de front d’onde ultra rapide pour focaliser dans des milieux diffusants biologiques (Blochet) pdf
A75 Exploring multiple color 3D STORM microscopy. (Danglot & Piolot) pdf
A76 Imag’in Adult Brain network: comment concilier résolution et profondeur pour une analyse 3D ? (Danglot & Dufour) pdf
A77 Impression 3D pour la biologie et ses systèmes d’acquisition (Detailleur & Leconte) pdf
A78 In toto imaging of developing embryos by SPIM (PhaseVIew upright microscope or Leica inverted microscope) or horizontal 2-photon LSM (LavisionBiotech) (Peyrieras) pdf
A79 Induction of micropattern of biological activity by high-resolution optogenetic control through a DMD module. (Destaing) pdf
A80 Le pointillisme: état des lieux (Durel & Bourdoncle) pdf
A81 LEGOLish Learning Light Sheet microscopy playing with LEGOs (Andilla) pdf
A82 Maitrise des conditions expérimentales d’imagerie photonique (Geny & Schapman) pdf
A83 Microscopie confocale de réflexion couplée à la fluorescence pour étudier l’interaction de cellules avec la surface de matériaux opaques et/ou structurés (Petithory & Pieuchot)
A84 Pilotage d’une source multi-LED et application à une sonde photo-inductible: Cry2-CIBN (Schaub & Gesson) pdf
A85 Spatial distribution analysis of 3D intracellular events (Pécot & Kervrann) pdf
A86 Time-gated microscopy used to resolve terbium to quantum dot FRET in cells (Cardoso dos santos & Hildebrandt) pdf
A87 Which super-Metrology tools for super-resolution microscopy ? (Faklaris & Fiche) pdf
A88 Atelier approche théorique – Camera Simulation Engine (Virtually test camera performance) (Flores-flores) pdf
A89 Atelier approche théorique – FluoSim: Single molecule dynamics simulator for live cell fluorescence imaging and super-resolution microscopy (Thoumine & Lagardère) pdf
A90 Atelier approche théorique – La microscopie STED : de la préparation à la super résolution (Goudin &amp Lebreton)
A91 Atelier approche théorique – Simulation et analyse de trajectoires intracellulaires ou membranaires (Berry & Favard) pdf

 

Pré-Modules

PM1 – Optique pour les nuls PM1-1PM1-2
Intervenant : Olivier Haeberlé (Mulhouse)

PM2 – Fondamentaux des techniques de super-résolution PM2
Intervenants : Guillaume Dupuis (Orsay) et Nicolas Bourg (Orsay)

PM3 – Sources lumineuses en microscopie PM3
Intervenants : Sébastien Marais (Bordeaux) et Quentin Beaufils (Lille)

PM 4 – Bases en expérimentation et simulation des dynamiques moléculairesPM4
Intervenants : Hugues Berry (Lyon) et Cyril Favard (Montpellier)

PM 5 – Bases en analyse d’imagePM5-1 PM5-2

Intervenants : Alain Dieterlen (Mulhouse) et Yves Usson (Grenoble)

PM6 – Fondamentaux en biologie cellulaire PM6
Intervenants : Gabriel Bidaux (Lyon), Delphine Muriaux (Montpellier)

PM 7 – Fondamentaux de photochimie pour l’imagerie en biologiePM7
Intervenant : Dominique Bourgeois (Grenoble)

Modules avancés

ISO 9001 ET NFX50-900 : Un outil de management pour les plateformes.MA-1
Proposer/Coanimator
Cecile Pouzet
Anne Mazars

Microscopie avec lumière synchrotron MA-2
Proposer/Coanimator
David Rousseau
Bertrand Cinquin

Déconvolution 3D MA-3
Proposer/Coanimator
Bruno Colicchio
Orestis Faklaris

Au delà de la métrologie / Beyond metrology
Proposer/Coanimator
Aurélien Dauphin
Damien Schapman

La gestion des données image et leur valorisationMA-5
Proposer/Coanimator
Perrine Paul-Gilloteaux
Cedric Matthews

Imagerie des organismes marins: Défis et intérêts
Proposer/Coanimator
Nathalie Turque

Comptes rendu des tables rondes

CULTURES CELLULAIRES CONTROLEES: MICROPATTERNING, BIOPRINTING ET APPROCHES ALTERNATIVES POUR CONTROLER IN VITRO LE PHENOTYPE, LE DEVELOPPEMENT DES CELLULES ET LEUR ENVIRONNEMENT.TR1
Proposer/Coanimator
Steven Nedellec
Pierre-Olivier Strale

CHOIX DES FLUOROCHROMES EN MICROSCOPIE DE SUPER-RESOLUTION STED TR2
Proposer/Coanimator
Sophie Allart
Patrice Mascalchi

PREPARATION D’ECHANTILLONS POUR LA MICROSCOPIE DE SUPER-RESOLUTION DSTORM TR3
Proposer/Coanimator
Béatrice Durel
Nicolas Bourg

L’IMPRESSION 3D AUTOUR DE LA MICROSCOPIE TR4
Proposer/Coanimator
Brice Detailleur
Ludovic Leconte

DES INSTRUMENTS ET DES HOMMES TR5
Proposer/Coanimator
Cedric Matthews
Isnardon Daniel

BIO IMAGE ANALYSTS: A NEW JOB TR6
Proposer/Coanimator
Perrine Paul-Gilloteaux
Fabrice Cordelières

LES LOGICIELS POUR LE DEVELOPPEMENT ET LE TRANSFERT DE PROTOTYPE TR7
Proposer/Coanimator
Marc Tramier
Rémy Flores-flores

TRANSFERT TECHNOLOGIQUE EN MICROSCOPIE PHOTONIQUE POUR LA BIOLOGIE EN MILLIEU ACADEMIQUE : LES VERROUS TR8
Proposer/Coanimator
Sandrine Lecart
Caroline Clerte

REPOSITIONNEMENT ET RELOCALISATION EN MICROSCOPIE CORRELATIVE TR9
Proposer/Coanimator
Astrid Canivet
Adeline Mallet

TR MODULE4 TR-M4

TR MODULE5 TR-M5

TR MODULE6 TR-M6